Periodontal tedavinin uluslararası olarak belirlenen bir tedavi protokolü bulunmaktadır. Bu tedavi protokolüne göre kemik kaybı görülen bir bireyde birincil olarak yapılması gereken Periodontal Başlangıç Tedavisi (Initial Periodontal Therapy) ve ağız hijyeni eğitimi verilmesidir. Bu aşama en basit ama temel aşamadır. Aynı zamanda tüm periodontal işlemlerin başlangıç noktasıdır.
Periodontal başlangıç tedavisi aşamasında kısaca anlatmak gerekirse diş yüzeyi temizliği, kök yüzeyi düzleştirilmesi (küretaj) yapılmaktadır. Bunlara ek olarak periodontal tedavi gören bireye ağız hijyeni eğitimi verilerek kişiye göre hangi diş fırçası, hangi arayüz bakım ürününün daha etkili olabileceği seçilir ve reçete edilir. Bu süreç kişiye göre değişmekle beraber 1 seansta yapılabildiği gibi 6 seans kadar da sürebilmektedir. Seans sayısını periodontoloji uzmanı ağız içi muayene ve röntgen ile durumu değerlendirdikten sonra belirlemektedir. Seanslar genellikle 30-45 dakika aralığında sürmektedir ve lokal anestezi altında yapılmaktadır. Periodontal başlangıç tedavisi tamamlandığında dişlerde var olan diğer sorunların (dolgu, kanal tedavisi, protez değişimi vb) planlanarak yapılması gerekmektedir.